计算机科学与工程系成立于1995年，同年创办三年制专科"计算机应用"专业。经省教育委员会批准，我校于2000年开始招收第一届计算机科学与技术全日制本科生。现设有软件工程一级硕士点和农业工程与信息技术专业学位硕士点，计算机科学与技术本科专业（含网络工程、软件服务外包两个专业方向）。2005年被批准为计算机应用技术硕士学位授权单位；2007年被批准为农业信息化专业学位硕士单位；2012年计算机科学与技术专业被江苏省教育厅确定为江苏省卓越工程师（软件类）教育培养计划试点专业。
计算机科学与工程系下设数据挖掘、网络工程、林业信息三个学科组，拥有专职教师27人。其中具有高级职称的教师10人，具有博士学位的教师14人。师资队伍年龄结构、学历结构、职称结构相对合理，学术水平较强，并已逐步形成以林学相交叉的学科特色。
计算机科学与工程系不仅承担着计算机本科专业、硕士点学科的课程教学任务，而且承担了全校各专业的本科、硕士、博士计算机类基础课程的教学和实习任务，以及系组自身的科研任务。
主 任：云 挺
副主任：张 严 范习健
教 师：业 宁 杨绪兵 张 威 何煦岚 王一雄 胡永东 刘晓峰
汪 力 高德民 张福全 张 严 徐 枫 薛联凤 章春芳
沈丽容 王文贝 袁庆萍 张 涛 张雪峰 韦素云 王 阗
朱 璟
